Trtase dunha ferramenta bioinformtica do Centro Nacional de Աپs Oncolxicas
PanDrugs selecciona o mellor tratamento farmacolxico contra o cancro segundo as mutacins do tumor
Miguel Reboiro e Daniel Gonzlez participaron no seu desenvolvemento
Unha plataforma bioinformtica que prioriza os tratamentos farmacolxicos contra o cancro de acordo cos datos xenmicos individuais de cada persoa. Deste xeito preséntase PanDrugs, unha ferramenta posta en marcha polo Centro Nacional de Աپs Oncolxicas CNIO e en cuxo desenvolvemento participaron os enxeeiros informticos da Escola Superior de Enxeara Informtica do campus de Ourense Miguel Reboiro e Daniel Gonzlez.
O proxecto foi financiado polo Ministerio de Economa, Industria e Competitividade, a Xunta de Galicia, o Fondo Europeo de Desenvolvemento Rexional, contando coa implicacin do Centro de Աپ, Transferencia e Innovacin da 鶹 e o Instituto de Saúde Carlos III. No último número da revista Genome Medicine 2018 preséntase a ferramenta e varios casos nos que xa foi empregada nun artigo titulado PanDrugs: a novel method to prioritize anticancer drug treatments according to individual genomic data, asinado de ademais de por Miguel Reboiro e Daniel Gonzlez por Ftima Al-Shahrour, Elena Pieiro, Gonzalo Gmez, Javier Perales, Kevin Troulé, José Manuel Rodrguez, Héctor Tejero, Takeshi Shimamura, Pedro Pablo Lpez, Julin Carretero, Alfonso Valencia e Manuel Hidalgo.
O desenvolvemento de PanDrugs, explican Miguel Reboiro e Daniel Gonzlez, xorde no marco da lia de colaboracin aberta desde hai varios anos entre estes dous enxeeiros informticos do Grupo de Աپ Sing Sistemas Informticos de Nova Xeracin da 鶹 e o Centro Nacional de Աپs Oncolxicas. A posta en marcha desta aplicacin, detallan, faise no marco do auxe que est tendo a “medicina personalizada” que, sinalan, no caso das persoas con cancro “é especialmente interesante”. As, explican os investigadores da 鶹, unha mesma tipoloxa de tumor pode ter orixes diferentes en pacientes diferentes e cada paciente pode ter unha reaccin diferentes medicacin en funcin desta orixe.
A potencia do seu repositorio
O sistema de PanDrugs, comentan Reboiro e Gonzlez, basea esta atencin personalizada en secuenciar o xenoma do tumor do paciente e buscar a mutacin ou mutacins que deron lugar a esa enfermidade e en base a esas mutacins decidir cal é o mellor tratamento para ese paciente en concreto. Para acadar este obxectivo, detallan, desenvolveron unha meta base de datos que integra informacin de moitas bases de datos. Deste xeito, o persoal médico ten a posibilidade de que, introducindo a secuencia xenética do tumor e tras detectar as mutacins existentes, o sistema informtico ofrece diferentes tratamentos farmacolxicos posibles puntuados. Deste xeito, sinalan os investigadores, PanDrugs non s ofrece o tratamento con mis probabilidades de éxito segundo a informacin manexada senn que tamén proporciona alternativas s que se pode recorrer en caso de que a primeira proposta farmacolxica non tea resultados positivos.
“O noso traballo consistiu no desenvolvemento da ferramenta en si, da plataforma informtica”, comentan os investigadores do campus de Ourense. As, destacan desde PanDrugs, a potencia desta ferramenta recae en parte en que constitúe o repositorio público mis grande de relacins frmaco-diana, que abranguen desde as terapias dirixidas empregadas hoxe en da en clnica ata compostos en fase preclnica. A versin actual do sistema integra datos procedentes de 24 fontes primarias e é capaz de xerar 56.297 asociacins frmaco-diana obtidas da posible combinacin de 4804 xenes e 9092 compostos únicos.
No desenvolvemento informtico desta ferramenta, os investigadores da 鶹, que recentemente iniciaron tamén un proxecto de investigacin centrado no uso de intelixencia artificial para a deteccin e clasificacin en tempo real de lesins colorrectais, veen traballando desde o ano 2015. Coa aplicacin xa funcionando, o vindeiro mes, afirman os enxeeiros informticos do campus de Ourense, volver a reunirse o equipo que a elaborou para continuar perfeccionando PanDrugs.