DUVI

Diario da 鶹

Adquirronse varios equipos para o CACTI por un importe de 3’3 millns de euros

Tecnoloxa punta para a secuenciacin masiva de xenomas

Anlise xenmica de tumores e estudo de enfermidades hereditarias son algunhas das súas aplicacins

Etiquetas
  • Vigo
  • Աپ
D. Besado DUVI 09/05/2014

O estudo de mutacins en enfermidades hereditarias e a secuenciacin de tumores son dous exemplos das múltiples aplicacins da nova tecnoloxa de secuenciacin masiva do xenoma humano adquirida pola Universidade, dous equipos de última xeracin considerados como “unha ferramenta moi valiosa” para os investigadores do eido da biomedicina, pero tamén de gran utilidade en mbitos como o estudo de organismos marios, agricultura, microbioloxa... Cun valor superior aos 500.000 euros, este sistema de anlise xenmico adquiriuse de maneira conxunta con outros equipos para as plataformas de protemica, transcritmica... En total foron 3.382.000 euros, dos que o Ministerio de Economa e Competitividade financiou 2,4 millns –Axuda de Infraestrutura cofinanciada con fondos Feder- e a Universidade a cantidade restante.

Estes novos secuenciadores, denominados Personal Genome Machine e Ion Proton, estn a disposicin da comunidade investigadora, centros tecnolxicos e empresas no Servizo de Xenmica do Centro de Apoio Cientfico e Tecnolxico Աپ, CACTI. “Son equipos que permiten coecer en paralelo a secuenciacin de millns de fragmentos de ADN, producindo inxentes cantidades de datos que son posteriormente procesados informaticamente e que permiten a anlise de xenomas completos ou de parte deles con gran profundidade”, recalca Ángel Sebastin Comesaa, responsable do servizo, que explica que desde 2003, cando se publicou a secuencia do xenoma humano usando o método tradicional de Sanger, desenvolvéronse novas tecnoloxas que facilitan a secuenciacin do xenoma cun custe cada vez menor, tanto en tempo como en dieiro.

Nos novos equipos adquiridos polo CACTI a secuenciacin do ADN realzase nun chip duns sete centmetros cadrados, pequenas placas de laboratorio nas que hai toda unha inmensidade de pozos ou concavidades para realizar en paralelo a secuenciacin de millns de fragmentos de ADN de pequeno tamao, o que facilita que se poida abordar da maneira mis “rpida, sinxela e econmica” desde a secuenciacin completa de xenomas bacterianos ou vricos ata xenomas humanos.

Secuenciados con éxito varios tecidos tumorais humanos

A activacin ou non de determinados xenes, as como o seu nivel de expresin pode ser diferente en distintos tipos celulares alterando rutas metablicas importantes. “Estas rutas metablicas e os xenes implicados nelas poden ser dianas terapéuticas”, subliou Sebastin, acompaado da técnica Vernica Outeirio, que explicaron que esta é unha parte importante na que os investigadores centran os seus estudos e que, neste sentido, os novos equipos permiten a secuenciacin de transcritomas ou ARN celular en pouco tempo e cun custe aceptable.

Nos meses que leva en funcionamento o novo sistema de anlise xenmico xa se secuenciaron con éxito varios transcritomas, unha ferramenta moi útil no estudo de enfermidades coma o cancro, xa que con estas técnicas non s se poden coecer que xenes presentan mutacins que poden ter unha relacin directa ou indirecta coa enfermidade, senn en que grado se manifestan en tecidos normais e en tecidos tumorais. O primeiro destes transcritomas secuenciado con éxito con estes novos equipos realizouse en colaboracin do doutor Francisco Gambn do Hospital do Meixoeiro e para conseguilo empregouse tecido tumoral de colon.

Tras esta primeira experiencia realizronse xa dous novos transcritomas para o Instituto de Medicina Oncolgica y Molecular de Asturias, IMOMA, consistentes en tecido tumoral metasttico en fgado e outro de control de tecido san.

“As aplicacins son moi numerosas”

“As aplicacins son moi numerosas” , recalca o responsable do servizo, ao tempo que explica que a secuenciacin de tumores pode proporcionar importante informacin para a decisin dos onclogos sobre a terapia a aplicar nun paciente concreto. Neste senso, os responsables explican que, ademais das súa aplicacin directa en temas relacionados coa saúde humana, esta ferramenta permite abordar estudos en acuicultura, xenética de poboacins, microbioloxa, etc., “coma estudar cntos e cles son os xenes relacionados con respostas inmunes a infeccins que se expresan en especies de interese comercial relacionadas coa acuicultura”. Ademais disto permite tamén coecer de maneira conxunta as especies que forman as poboacins bacterianas de solos, sedimentos, augas, etc.